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[转] siRNA,shRNA,dsRNA,miRNA间的区别

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发表于 2011-5-10 16:11:31 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式

6 p1 `9 y* M! j2 n9 _3 N- v    RNA干扰(RNAi),即用20多个核苷酸组成的短的双链RNAsiRNA)代替传统反义核酸进行转录后基因沉默,已经迅速而广泛地应用到基因功能,基因表达调控机制研究等热门领域,并为基因治疗开辟了新的途径。近两年来,这方面的科学论文及报道爆炸性增长,几乎每天都有新的结果涌现。这些论文中,出现了很多与RNA干扰相关的概念,意思很相近但并不完全相同,这里列举了几个常见的RNA干扰相关的名词及其简单的解释:
7 W3 e1 ^$ d7 I# N& |1   miRNA:在遗传学中,微RNAmicroRNAsmiRNA)是长度在21-23个核苷酸之间的单链RNA片段, 调节基因的表达。miRNA由基因编码,从DNA转录而来, 但不翻译成蛋白。初级转录产物(primary transcriptspri-miRNA)缩短其颈环结构得到功能性的miRNA。成熟的miRNA分子与一个或更多个mRNA分子部分互补,其主要功能是下调基因的表达。而microRNA这个概念第一次在2001Science (26 October 2001)的文章中出现。
; U4 I; C5 H! c) }1 x2   dsRNA 双链RNAdouble-stranded RNA, dsRNA)是一种有互补链的RNA,与细胞中发现的DNA相似,dsRNA构成了一些病毒(双链RNA病毒)的基因组。像病毒RNAsiRNA之类的 双链RNA能够促发真核细胞中的RNA干扰,引起脊椎动物中的干扰素反应。1 b& b6 k2 U/ \0 n  V1 ^
3   shRNA:小发卡或短发卡RNAa small hairpin RNA or short hairpin RNA, shRNA)是一段具有紧密发卡环(tight hairpin turn)的RNA序列,常被用于RNA干扰沉默靶基因的表达。利用载体把shRNA导入细胞,载体中的U6 启动子确保shRNA总是表达;这种装载了shRNA载体可被传递到子代细胞中去,从而使基因的沉默可被遗传。shRNA的发卡结构可被细胞机制切割成 siRNA,然后siRNA结合到RNA诱导沉默复合物上(RNA-induced silencing complexRISC),该复合物能够结合到目的mRNAs并将其降解。shRNA 是由RNA 聚合酶转录的,哺乳细胞中的shRNA产物有时会促使细胞产生干扰素反应(细胞遇到病毒侵袭时做出的自我防卫反应),而miRNA中却不会遇到这种问题 miRNA是由RNA聚合酶转录,与转录mRNA的聚合酶相同)。shRNA也被用于植物和其它系统中,在这些系统中不需要U6启动子的驱动。在植物中,常用的增强表达的启动子是CaMV35Scauliflower mosaic virus 35S,在这种情况下,RNA聚合酶参与了转录,起始RNA干扰。
4 w" I8 A' l7 ^  g4   siRNA:小或短干扰RNAsmall/short interfering RNA, siRNA)是一类20-25个核苷酸长度的双链RNA分子,其主要在RNAi通路中起作用,干扰特异基因的表达。此外siRNARNAi相关的通路中也起作用,如抗病毒机制,基因组染色体结构的塑造等。其结构是一段完全互补的RNA双链,两端各有两个未互补的的碱基。
- R$ A4 g. [2 s7 U( }) x9 V1 n6 Z. j/ k0 \0 h( V; _' U
       最后,miRNAsiRNAdsRNAshRNA都是RNA干扰技术中用到的小分子RNA,其不同之处在miRNA 是单链RNA,其余均为双链RNAsiRNAdsRNA相似;shRNA需通过载体导入细胞后,然后利用细胞内的酶切机制得到siRNA而最终发挥 RNA干扰作用。3 H' n( c- ]4 [+ E5 U9 c3 R# E( z
    RNAi是一种技术,siRNAshRNAdsRNAmiRNA是一些在技术中使用的片段。

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